L'immuno-oncologie à l'ère des omiques spatiales

La troisième école d'été "Immuno-Oncology in the spatial omics era" entièrement en anglais, permettra aux étudiants internationaux en doctorat et en master d'explorer le domaine de l'omique spatiale pour étudier la complexité et l'organisation des tissus à différents niveaux grâce à l'imagerie transcriptomique, protéomique et métabolique afin de mieux comprendre l'immunité tumorale.

L’Institut Cancer et Immunologie est heureux d’ouvrir les inscriptions pour la 3ème édition de son école d’été en immuno-oncologie, dont le thème cette année est « L’immuno-oncologie à l’ère de l’omique spatiale ». Le programme mettra un accent particulier sur l'interaction entre la théorie, la recherche et la pratique autour de l'approche par problèmes. Il comprendra des travaux dirigés, des cours théoriques et techniques, dispensés par des professeurs locaux et des ateliers pratiques organisés en petits groupes dans des laboratoires locaux pour permettre aux étudiants d'effectuer des manipulations expérimentales et des analyses des données expérimentales. Des conférenciers internationaux rythmeront le programme en donnant à la fois des séminaires présentant l’état de l’art de l’omique spatiale ainsi que des séminaires de recherche approfondie dans les différents modules.

Le programme mettra un accent particulier sur l'interaction entre la théorie, la recherche et la pratique autour de l'approche par problèmes. Il comprendra :

  • Tutoriels
  • Cours théoriques et techniques, dispensés par des professeurs locaux et des ateliers pratiques organisés en petits groupes dans des laboratoires locaux pour permettre aux étudiants d'effectuer des manipulations expérimentales et des analyses de données expérimentales.
  • Des conférenciers invités rythmeront le programme en donnant à la fois des séminaires présentant l’état de l’art de l’omique spatiale ainsi que des séminaires de recherche approfondie dans les différents modules.
  • Histoire et développement de l'omique spatiale dans le contexte de la recherche en cancérologie et en immunologie 
  • Module d'introduction générale
  • Les principes et techniques qui seront développés lors des ateliers pratiques 
  • Module technologique général
  • Transcriptomique spatiale
  • Protéomique spatiale
  • Métabolisme spatial
  • Module informatique et statistique

Cette formation permettra aux étudiants de :

  • Développer ou approfondir des connaissances techniques et théoriques en omique spatiale de pointe pour l’étude de questions en oncologie et immunologie
  • Développer une pensée critique pour accompagner le choix, le développement et la validation des techniques d’omique spatiale
  • Développer des compétences en création de données spatiales omiques (expérimentation)
  • Développer des compétences en analyse de données spatiales omiques (analyse bio-informatique)
  • Organiser, analyser et promouvoir un projet scientifique basé sur des approches expérimentales d’omique spatiale
    De plus, ce programme fournira aux étudiants une base solide, qui pourra être utilisée tout au long de leurs études de master et de doctorat, soit dans le cadre de travaux expérimentaux, soit lors de la lecture de la littérature scientifique. Des ateliers pratiques et des mini-projets de recherche offriront une expérience inestimable.

Le volet mobilité physique se déroulera du 7 au 11 juillet 2025 à Marseille. L'école d'été intensive de 5 jours présentera, sous forme de modules, les technologies spatiales omiques et comment elles façonnent l'avenir de l'immunothérapie :

  • Un module d'introduction générale qui offrira aux participants un aperçu de l'histoire et du développement de l'omique spatiale dans le contexte de la recherche en cancer et en immunologie
  • Un module technologique général qui présentera les principes et techniques qui seront développés lors des ateliers pratiques
  • Un module sur la transcriptomique spatiale
  • Un module sur la protéomique spatiale
  • Un module sur le métabolisme spatial
  • Un module informatique et statistique
    Ces technologies regroupent différentes techniques permettant de superposer des données omiques aux images tissulaires pour l'étude et l'analyse de molécules biologiques et leur localisation dans un tissu où le contexte spatial d'origine est conservé.

La partie virtuelle du programme se déroulera du 1er février au 6 juillet 2025 et consistera en un module européen « Nouvelles techniques en protéomique, imagerie génomique et cytométrie » avec un format asynchrone. Les étudiants pourront suivre les cours à distance via Zoom avant le 6 juillet 2025.

Aussi, pendant une période de 15 jours, précédant la partie physique, une plateforme Moodle sera mise à disposition des étudiants pour la mise en place de mini-projets de recherche, les « Défis Spatial omics », dans le cadre de la mise en œuvre pédagogique active, que les étudiants présentera lors de la partie physique une fois les cours et ateliers terminés.

Les étudiants travailleront en groupes de 5, avec des articles de recherche fournis par les enseignants. Chaque groupe sera animé par un enseignant-chercheur AMU ou CIVIS. Ensemble, ils répondront "Comment concevoir un plan expérimental utilisant une technique omics donnée pour répondre à une question biologique donnée".

Cette formation est ouverte aux étudiants de Master et de Doctorat des universités membres de CIVIS, possédant une certaine expérience en immunologie, oncologie, biologie cellulaire et moléculaire et/ou biophysique.

De plus, les participants doivent avoir d'excellentes compétences en anglais (B2) et doivent fournir une lettre de recommandation d'un professeur et/ou d'un directeur de recherche qui le connaît bien.

Pour être éligible au programme CIVIS que vous avez sélectionné, vous devez être un étudiant pleinement inscrit dans votre université d'origine CIVIS au moment où vous entreprenez le programme.

Les étudiants des universités partenaires stratégiques de CIVIS en Afrique ne peuvent pas postuler pour participer à ce cours.

Envoyez votre candidature en remplissant le formulaire de candidature en ligne avant le 31 octobre 2024, comprenant :

  • CV
  • Lettre de motivation
  • Lettre de recommandation d'un professeur et/ou d'un directeur de recherche
  • Les candidatures seront évaluées sur la base des documents ci-dessus.

                                    Programme

                                            Affiche